Мотоциклетите на BMW, и по-специално R12 и R75, са широко използвани от моторизираните подразделения на германската армия. BMW R75 е с кош, като и колелото на коша е задвижвано с помощта на диференциал за постигане на висока проходимост на мотоциклета. Самолетите също използват BMW 801, един от най-мощните за времето си самолетни двигатели. Над 30 000 такива двигатели са произведени до 1945 г.
Заводите на BMW са сериозно бомбардирани обекти в края на войната. Тези в Източна Германия са превзети от Съветския съюз, а заводът в Мюнхен е напълно унищожен
