В Рила се намират пет резервата — Парангалица, Централен Рилски резерват, Ибър, Скакавица иРиломанастирска гора с обща площ от 19 898,6 ha. Първите четири са разположени в Национален парк Рилакато 89,4% от площта им представлява гори, високопланински ливади и пасища. Резерватът Риломанастирска гора попада в създадения през 2000 годинаПрироден парк Рилски манастир. Парангалица и част от Централен Рилски резерват са вписани в Списъка на биосферните резервати на ЮНЕСКО в рамките на програмата „Човек и биосфера“
